Néhány rosszakarója jóvoltából olyan pletykák keltek szárnyra, hogy Ecclestone-nak köze volt az 1963-as „Nagy Vonatrablás” néven elhíresült bűncselekményhez, amelyben az elkövetők két és fél millió fontot lovasítottak meg. A menekülő rablók autóját ugyanis egy Formula-3-as versenyző Roy James vezette, akit később le is csuktak. A „menyét” becenévre hallgató James levélben kereste meg régi cimboráját Grahamt Hillt, hogy szabadulása után segítsen neki pilótaülést találni. Szabadulása után Ecclestone adott tesztlehetőséget James számára, ám az eredmények láttán szóba sem jöhetett versenyzőként való alkalmazása. Amikor azonban kiderült, hogy Roy korábban aranyműves volt, Bernie felajánlotta számára, hogy készítsen ezüsttrófeákat a Formula-1 számára. Ez azonban elég volt ellenségeinek. Pillanatok alatt elterjedt, hogy az akció értelmi szerzője „Mr. E” volt, aki ebből alapozta meg jó sorát. Először Ecclestone sem vette komolyan az egészet, csak legyintett: „Csak nem gondolják, hogy koszos két és fél millióért kirabolok egy vonatot? Ez arra sem elég, hogy az egyik versenyzőmet kifizessem belőle.” Az újságok viszont addig-addig csűrték csavarták a dolgok, mígnem Bernie hitelrontás címén pert indított egy újság ellen, amit meg is nyert.